Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM31Q9BZY9 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms