Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TRIM55Q9BYV6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms