Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BBS2Q9BXC9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms