Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MCMBPQ9BTE3 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms