Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
C2orf88Q9BSF0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms