Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NAP1L3Q99457 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NAP1L3Q99457 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms