Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBXN4Q92575 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms