Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SFRP1Q8N474 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SFRP1Q8N474 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms