Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RASGEF1CQ8N431 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms