Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC50Q8IVM0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms