Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARCQ7LC44 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms