Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDZD4Q76G19 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms