Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q71RC1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q71RC1 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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