Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC131235.2-201ENST00000445553 1057 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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FAM208BQ5VWN6 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
FAM208BQ5VWN6 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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FAM208BQ5VWN6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
FAM208BQ5VWN6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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