Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LGSNQ5TDP6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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