Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
KRTAP21-2Q3LI59 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms