Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RTL8BQ17RB0 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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RTL8BQ17RB0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RTL8BQ17RB0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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