Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RBBP7Q16576 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms