Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HLFQ16534 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HLFQ16534 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLFQ16534 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLFQ16534 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HLFQ16534 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms