Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNHIT3Q15649 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms