Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIX1Q15475 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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SIX1Q15475 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIX1Q15475 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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