Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCP1Q15431 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCP1Q15431 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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