Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PCOLCEQ15113 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms