Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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RAB3GAP1Q15042 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB3GAP1Q15042 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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