Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LAPTM4AQ15012 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms