Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CHD4Q14839 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHD4Q14839 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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