Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SSPNQ14714 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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