Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TRIM25Q14258 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms