Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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CKAP5Q14008 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CKAP5Q14008 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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