Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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CAPSQ13938 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CAPSQ13938 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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