Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PKP1Q13835 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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