Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HTR4Q13639 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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HTR4Q13639 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HTR4Q13639 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HTR4Q13639 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HTR4Q13639 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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