Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CUL3Q13618 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CUL3Q13618 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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