Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2DQ13557 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms