Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DUSP4Q13115 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DUSP4Q13115 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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