Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHAF1BQ13112 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHAF1BQ13112 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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