Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPS1Q13098 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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GPS1Q13098 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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GPS1Q13098 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPS1Q13098 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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