Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CSTF3Q12996 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CSTF3Q12996 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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