Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCB1Q12824 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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SMARCB1Q12824 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SMARCB1Q12824 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SMARCB1Q12824 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SMARCB1Q12824 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SMARCB1Q12824 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCB1Q12824 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms