Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARHGEF5Q12774 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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