Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
OTUD4Q01804 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
OTUD4Q01804 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms