Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SKOR1P84550 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms