Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TUBA4AP68366 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TUBA4AP68366 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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TUBA4AP68366 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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TUBA4AP68366 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TUBA4AP68366 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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