Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
USP46P62068 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
USP46P62068 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
USP46P62068 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms