Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVPABLB-1P60509 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVPABLB-1P60509 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms