Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLDN2P57739 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms