Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAD23AP54725 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms