Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HIRAP54198 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HIRAP54198 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms