Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNQ1P51787 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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