Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NESP48681 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NESP48681 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NESP48681 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NESP48681 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NESP48681 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NESP48681 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NESP48681 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NESP48681 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NESP48681 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NESP48681 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NESP48681 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms